不是可能存在,而是一定存在。
因为制备样本中的rrna占到了总rna的80%以上。
这样在测序时,准确性必然会受到无可估计的影响。
“梅林,你的担心是正确的。”陆时羡给予他认可的眼神道:“因此我们必须通过rna富集的方法去除rrna的干扰。”
说到这里,就算几人再迟钝脑中也迅速想起一个字眼。
“oligo-dt富集法?”
“没错。”陆时羡打了个响指:“虽然剔除rrna后进行wta也有人使用,但在学界里,由于样本质量的高效性,一般都适用oligo-dt对poly(a)rna进行富集。”
“rrna剔除法较之于oligo-dt富集的缺陷是要求更高的测序深度,不然样本的rrna依然会存在一定的数量,富集效果并没有达到想要的程度。”
这话说的已经非常直白了,以至于后面的操作流程都无需继续强调了。
不过陆时羡还是非常认真地继续着接下来地进行操作。
然后,才终于来到了最后的测序环节
这就是会议上曼伦教授要求陆时羡小组所做的全部工作。
看似只有两个字,但需要完成的工作实则非常繁琐和细致。
三人接下来停止了手里的工作,围站在陆时羡周围看着他操作。
俗话说外行人看热闹,内行人看门道。
别人可能看的一头雾水,但他们还不至于连操作的内容都看不懂。
对rna进行片段化及纯化操作。
对片段化rna的产量及片段大小分布进行分析。
对cdna进行反转录、纯化以及扩增,选择适宜的片段大小建立扩增文库。
对扩增后dna产量及片段大小的分布进行分析。
而此时的鲍勃简直惊呆了,一旁的梅林和瑟琳也有些震撼。
因为操作到这一步,也就是他们三人之前一直在练习熟练的环节。
鲍勃眼睛睁大,有些不可思议地说道:“陆博士?这种精细的微观实验操作,你的动作似乎比之前还要快了。”
其实,他并不是第一次和陆时羡合作实验的萌新。
作为主攻方向为生物技术的研究生,他的实验操作技术在实验室里其实算的上是一把好手。
这跟他之前喜欢观摩很多同学、教授甚至是耶鲁实验大牛的实验操作过程分不开。
比他菜的他喜欢看,这样就像学长学姐幸灾乐祸地看低年级新生顶着烈日进行体检一样,让他很有优越感和成就感。
比他强的他也喜欢看,因为一次优秀的实验操作就像是放映一场电影特效大片。
流畅、清晰、震撼、动人心魄。
但也因此给他更大的惊讶感。
就算在顶级实验室里,你也可以不懂原理,但你绝不能不懂操作。
在这里,操作就是重中之重。
这就存在很多研究生其实压根
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